Деканат отказал в заявлении на обжалование приказа

Сначала в ректорат, потом в минобр, либо какая там инстанция непосредственно выше? Управление образования или как называется? Узнайте, и пишите туда. Можете одновременно в ректорат и сразу выше написать, в этом случае внизу заявления в ректорат напишите: копия настоящего заявления направлена в... (название инстанции).

По электронной почте или почтовой службой заказным письмом с опиью вложения

А что вы хотите то?
Если у вас справки и вы не успеваете сдать сессию, то берете академ.
Не взяли, значит должны сдать

Что-то вы лукавите. Если вы говорите о справках - значит, у вас есть справки, по которым вам должны продлить срок сдачи сессии. Но вас отчислили за долги каких-то прошлых сессий. Ближайшая прошлая сессия была зимой. Вы четыре месяца серьезно болели..? Что-то мне подсказывает, что нет. Более того, перед приказом вас миллиард раз предупреждали. И ни в одно из предупреждений вы не предоставили деканату медицинские документы, что не имеете возможности сдавать. Отсюда и отказ. Можете попробовать начать с прокуратуры. Они занимаются соблюдением законов и посоветуют, в какую инстанцию обратиться дальше. Но 99,9% вам отказали законно.