У меня похожая ситуация, цикл с подросткового возраста был нерегулярным, принимала разные средства, но цикл все равно скакал. Зимой этой была у врача и мне Актиферт-гино прописали, пила месяца 3 курсом. Сначала тоже были коричневые выделения, как у вас, но врач сказал, что это допустимо на адаптационном этапе. Примерно через пару недель всё прошло, и со временем цикл стал стабильнее. Важно не прекращать приём без консультации, и если что-то беспокоит, лучше все же еще раз обсудить с гинекологом.