Ну вообще можно подписать файл практически любого формата. Некоторые программы просто заточены под определенный формат типа офис сигниче или крипто про пдф. Поэтому наш офис перешел на Криптоарм, и вообще проблем не знаем с новыми форматами файлов, если их надо подписать.