Вы можете взять ипотеку только на то, на что есть документы. Банк их проверяет перед тем, как одобрить сделку. В вашем случае дома по документам нет, и кредит будет на покупку земельного участка.
Если сам участок стоит значительно меньше, и такая стоимость из-за того, что там стоит дом, то с одобрением могут возникнуть проблемы.

Меня бы смутил тот факт, что продавец не стал оформлять дом самостоятельно. Так ведь продать дом проще и денег можно просить больше. Уточните, не построен ли дом с нарушениями пожарных требований и т.п. То есть легко ли его будет в дальнейшем оформить.