А почему бы и не обсудить? Вы обе владеете собственностью. Обязанность владельца содержать свою собственность на должном уровне: делать своевременно ремонт, поддерживать коммуникации на должном уровне. Обязанность у всех собственников! Если квартира от этого становится дороже, то в последствии это будет иметь существенное значение. Конечно нужно обсуждать эти вещи и фиксировать договоренности на бумаге. Собирать подтверждение своих расходов (договора с ремонтниками, чеки на покупку стройматериалов, сантехники и пр.).
Вы опасаетесь, что сестра может переехать к Вам из-за развода (если вдруг). Но может и по другому быть - потребует раздела имущества. У вас будет преимущественное право выкупа половины квартиры, а если нет, может и продать третьему лицу. Так что обсуждать все эти моменты нужно обязательно!