Зря боитесь. Да нервы это одна сеть в организме и часто бывает когда воспаление нерва в одном месте ощущается как боль в другом. Это норма, и не только зубов касается.
Анестезия на то и придумана чтобы как бы отключить один сегмент этой сети от мозга. Как только ее поставят у вас пройдет боль. Дальше воспаленный нерв как бы отрежут от сети полностью и боль не вернется. Лечите, ничего не бойтесь.