Насколько законно требование к ученику 16 лет встать на воинский учёт?

Законно. На учет ставят в год исполнения 17 лет ДО того, как исполнилось 17 лет.

воинский учет в любом случае нарушение прав человека

вывод: не жить в гондурасах где он существует

Бред

Ответственность
Уклонение от исполнения обязанностей по воинскому учёту влечёт административную или уголовную ответственность:
mokupchino.ru
Административная ответственность — статья 21.5 КоАП РФ за нарушение правил воинского учёта: неявка в военкомат по повестке, несообщение об изменениях, влияющих на учёт, неявка для постановки или снятия с учёта. Штраф — от 500 до 3 000 рублей.
Уголовная ответственность — статья 328 УК РФ за умышленное уклонение от призыва на военную службу без законных оснований. Наказание — штраф до 200 000 рублей, либо обязательные работы, арест до 6 месяцев, или лишение свободы до 2 лет.