Что дарить научному руководителю? И дарить ли?

Ничего. Спасибо только.

Минет ему подари с проглотом

Если работа с научным рук-лем была действительно плодотворной, он отвечал дельно и вовремя, и вы, автор, имеете желание его за это отблагодарить, то все зависит от вашего бюджета. Если намучились с курсовой или дипломом и не остались впечатлены вашей совместной работой - то и ну его нафиг :) Отложите деньги на что-то более стоящее. Никакой традиции не существует, порядок подношения подарков определяется студентами самостоятельно