Налоговая может отказать в вычете за квартиру?

Оформите налоговое уведомление для работодателя, будете получать чистую зп без вычета из нее подоходного налога.

Может отказать при определённых условиях. И это будет законно. Прочитайте в интернете, при каких условиях даётся вычет (от доходов он не зависит, он зависит от срока владения недвижимостью).

Она про квартиру спрашивает, налог на недвижимостью, а не про подоходный налог.

Она же про налоговый вычет спрашивает

ты не понимаешь, что такое вычет. если ты заплатила ноль налогов, то и вычет твой тоже будет ноль. налоговая не откажет себе в таком удовольствии

Если автор сейчас работает официально и платит налоги, то она может оформить налоговое уведомление и не платить их, а получать зп целиком.

Я получаю белую зп, квартира куплена в прошлом году, формально всё сходится.
Волнует только, что стоимость квартиры пока превышает все мои вместе взятые доходы. Или это совсем неважно?

Конечно неважно. Вычет не зависит от размера вашей зп.

Автор, если Вы работаете официально и платите Ндфл (в народе подоходный), то Вы имеете право на вычер в размере уплаченного Ндфл, главное, чтобы жилье было приобретено на Ваше имя.