В туалете молиться точно не стоит, разве что в какой-то безвыходной ситуации. Насколько я зеаю, по нашим древним обычаям даже баня считалась как бы неподходящим для молитвы местом, не очень чистым. А уж тем более туалет. Но обычаи есть обычаи, они могут и меняттся. Однако в туалете - это как-то не айс. Но и нреха в этом большого нет, Вы это делали не из плохих побуждений. Молитесь лучше мысленно (и креститесь мысленно, если не хотите привлекать внимания), закрыв глаза или там глядя в окно, в сторону ближайшего Храма. Лично я делаю так. А вообще - любой батюшка Вам точнее скажет.