В бомжатник вселяться не нужно ради высоких потолков, замучаетесь потом ремонт делать, и соседи-алкаши будут мешать. А насчет санузла - видимо, для вас это важно. Кончено, ищите тогда вариант с раздельным. Я квартиру выбирала по куче параметров - чтобы высокий этаж, окна на южную сторону, большие окна, чтобы рядом был парк, обязательно газовая, а не электрическая плита, чтобы квартира была очень теплая, все в таком роде. При этом высота потолков, слитный санузел и наличие балконы мне были не важны. Это и есть самый рациональный выбор лично для вас - ведь вам в этой квартире жить. Если что-то сразу не нравится, не надо себя уговаривать.
Ещё от потолков высоких балдею. Тут вообще еле сдерживаю себя, чтобы не вселиться в какой-нибудь бомжатник, где зато высокие потолки.