Все верно. Прочерк в графе отец, А фамилия и отчество значения не имеют.
Ну и стоит все таки подумать еще раз. Не преувеличиваете ли вы масштаб проблемы, что аж хотите развод и ребенку прочерк в графе отец. Посоветую до родов ничего не решать. Можете съехать от него пока, а решение о разводе примите когда гормональный фон будет в норме.