Во время курса антибиотиков не критично, но вот после микрофлору нужно обязательно восстанавливать. Кстати, лучше это делать не пребиотиками, а синбиотиками. Например, в состав эваларовской Мультифлоры, помимо пребиотиков, входят 7 видов лакто- и бифидобактерий, поэтому и результат после ее приема будет куда лучше, чем от простых пребиотиков.