Есть знакомый, который содержит приют. По факту, это помещение на несколько комнат. Животные в вольерах не сидят, а бегают и играют между собой. Но это поскольку большинство из них находятся в приюте с детства и привыкли друг к другу. Агрессивных и некомпанейских животных лучше держать отдельно-и им, и вам спокойнее. Если Вы решите, что животные будут жить в комнатах, вам понадобится больше ветоши и моющих средств, т.к. за ними прийдется убирать. Лучше изначально приучать их к горшку/пеленке.
Насчет документации много не скажу, но знаю, что у каждого животного должен быть Международный паспорт. Все плановые прививки должны быть сделаны и занесены туда. Если животное долго находится в приюте, и его не берут, желательно стерилизовать.
Потом следующее-целевая аудитория. Должна быть группа волонтеров (чем больше-тем лучше), которая будет Вам помогать. Заводите страничку в соц. сетях или несколько в разных и регулярно обновляете. Составьте список вещей, которые принимает приют. Это корм, ветошь, моющие средства, резиновые перчатки, пеленки и т.д. Если имеются больные животные, то перевязочные средства. Можно организовывать сбор средств на карту.
Плюс поищите единомышленников, которые помогут содержать приют- в одиночку это проблематично. Удачи Вам!