Скорее всего это связано с условиями выращивания тыквы. Горечь вызывает группа природных химических соединений — кукурбитацины. В норме их уровень в съедобных сортах очень маленький. Однако при перекрестном опылении с декоративными сортами тыкв, которые как раз очень горькие и несъедобны, в плодах следующего поколения может резко повыситься концентрация этих токсичных веществ.
Внешне такая тыква выглядит абсолютно нормально. А горечь часто раскрывается именно после приготовления. Есть такую тыкву нельзя, можно получить пищевое отравление. Никакие методы готовки горечь не уберут. Выбросьте и не рискуйте здоровьем. В будущем пробуйте сырую тыкву на срезе, иногда легкая горчинка чувствуется уже тогда.